菏泽牡丹属中原牡丹种群，花色丰富多彩，花型千变万化。2012年菏泽牡丹已经发展为花色有粉色、红色（含紫红色）、紫色、蓝色、黄色、白色、黑色、绿色、复色总九大
色系，各色系有深、淡、浓之分。根据花朵形态和雌雄进化程度，分为单瓣型、荷花型、菊花型、托桂型、蔷薇型、金环型、皇冠型、绣球型、干台阁型、楼子阁型共十个花型。
菏泽牡丹有1100多个品种，各色系的菏泽牡丹都有名贵品种，如“
掌花案”花开似火，红光灿，为红色之魁；“
酒醉杨妃”红装素裹，低头掩面，暗送秋波；“
梨花雪”开若梨花，雪白一片，称白中之冠；“
昆山夜光”花开奇白，黑夜依然，古谓之“灯笼”；“
姚黄”金楼千层，世称花王；“
青龙卧墨池”如龙卧墨，黑中之奇；“
冠世墨玉”黑紫如缎，洁而有光；“
蓝绣球”开如绣球，蓝色之冠；“
赵粉”粉面桃花迎人笑，郁郁芳香飘四野；“粉二乔”粉紫同株，双娇可爱；“
魏紫”色紫浅淡多娇艳，古老品种称“花妃”；“
娇容三变”初开时碧绿，盛开时红艳，将谢时素白，十日三变，堪称奇品……菏泽也是中国最大的牡丹生产、科研、观赏基地，牡丹的种植面积、科研培植、观赏出口当称世界之最。
